В данном случае действует норма ст. 204 ГК РФ (Течение срока исковой давности при защите нарушенного права в судебном порядке), согласно которой срок исковой давности не течет со дня обращения в суд в установленном порядке за защитой нарушенного права на протяжении всего времени, пока осуществляется судебная защита нарушенного права.
Т.е. течение срока давности приостанавливается на период с момента подачи искового заявления в третейский суд до момента отказа в выдаче исполнительного листа (либо вынесения судебного акта вышестоящей инстанции при обжаловании). Соответственно, при обращении в госсуд необходимо написать пояснения со ссылкой на указанную норму, что срок давности не прошел. Потому что он именно перестал течь на период судебной защиты в третейском суде.
Если же все равно срок давности был именно пропущен даже с учетом периода, когда обращались в третейский суд, но незначительно, то можно ходатайствовать о восстановлении, ссылаясь на то, что максимально быстро после получения судебного акта об отказе в выдаче ИЛ, обратились с данным заявлением. Т.е. в ходатайстве о восстановлении необходимо обосновать, что срок давности пропущен крайне незначительно, по уважительной причине и при этом попытка защиты прав предпринималась.